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Journal articles
Combination of an Unbiased Amplification Method and a Resequencing Microarray for Detecting and Genotyping Equine Arteritis Virus
Aymeric Hans
1, *
Delphine Gaudaire
1
Jean-Claude Manuguerra
2
Albertine Léon
3
Antoine Gessain
4
Claire Laugier
1
Nicolas Berthet
4
Stephan Zientara
5
*
Corresponding author
Aymeric Hans 1
Correspondent author Employer institution : Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail IdHAL : aymeric-hans ORCID : https://orcid.org/0000-0002-6990-5735
Delphine Gaudaire 1
Author
Jean-Claude Manuguerra 2
Author
Albertine Léon 3
Author IdHAL : albertine-leon
Antoine Gessain 4
Author
Claire Laugier 1
Author
Nicolas Berthet 4
Author IdHAL : nicolas-berthet
Stephan Zientara 5
Author Employer institution : Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail IdHAL : stephan-zientara IdRef : https://www.idref.fr/07674745X ORCID : https://orcid.org/0000-0002-6733-8503 IDP INRA : https://test.federation.renater.fr/idp/shibbolethszientara
1
Laboratoire de Santé Animale [Goustranville] (France)
- ANSES - Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (14 rue Pierre et Marie Curie 94701 MAISONS-ALFORT Cedex - France)
2
CIBU - Cellule d'Intervention Biologique d'Urgence - Laboratory for Urgent Response to Biological Threats (Département Infection et Epidémiologie, 25-28 rue du Docteur Roux F-75724 Paris Cedex 15 - France)
- Institut Pasteur [Paris] (25-28, rue du docteur Roux, 75724 Paris cedex 15 - France)
3
Laboratoire Frank Duncombe (1 route de Rosel 14280 SAINT CONTEST - France)
4
EPVO (UMR_3569 / U-Pasteur_3) - Epidémiologie et Physiopathologie des Virus Oncogènes / Oncogenic Virus Epidemiology and Pathophysiology (Département de Virologie, 25-28 rue du Docteur Roux F-75724 Paris Cedex 15 - France)
- Institut Pasteur [Paris] : U-Pasteur_3 (25-28, rue du docteur Roux, 75724 Paris cedex 15 - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR_3569 (France)
- UP - Université de Paris : UMR_3569 (85 boulevard Saint-Germain 75006 Paris - France)
5
VIRO - Virologie UMR1161 (ENVA Maisons Alfort 7 avenue du Général de Gaulle 94704 MAISONS-ALFORT CEDEX - France)
- ENVA - École nationale vétérinaire d'Alfort (7 avenue du Général de Gaulle - 94700 Maisons Alfort - France)
- INRA - Institut National de la Recherche Agronomique : UMR1161 (France)
- ANSES - Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (14 rue Pierre et Marie Curie 94701 MAISONS-ALFORT Cedex - France)
Abstract : This study shows that an unbiased amplification method applied to equine arteritis virus RNA significantly improves the sensitivity of the real-time reverse transcription-quantitative PCR (RT-qPCR) recommended by the World Organization for Animal Health. Twelve viral RNAs amplified using this method were hybridized on a high-density resequencing microarray for effective viral characterization.
Document type :
Journal articles
Complete list of metadata
https://hal-normandie-univ.archives-ouvertes.fr/hal-02946322
Contributor : Erika Hue Connect in order to contact the contributor
Submitted on : Wednesday, September 23, 2020 - 9:17:59 AM
Last modification on : Tuesday, December 14, 2021 - 9:58:02 AM
Contributor : Erika Hue Connect in order to contact the contributor
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Last modification on : Tuesday, December 14, 2021 - 9:58:02 AM
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Identifiers
- HAL Id : hal-02946322, version 1
- DOI : 10.1128/JCM.01935-14
- PUBMED : 25339390
- PUBMEDCENTRAL : PMC4290937
Collections
COMUE-NORMANDIE | ANSES | CNRS | INRAE | UP-SCIENCES | PASTEUR | INRA
Citation
Aymeric Hans, Delphine Gaudaire, Jean-Claude Manuguerra, Albertine Léon, Antoine Gessain, et al.. Combination of an Unbiased Amplification Method and a Resequencing Microarray for Detecting and Genotyping Equine Arteritis Virus. Journal of Clinical Microbiology, American Society for Microbiology, 2014, 53 (1), pp.287-291. ⟨10.1128/JCM.01935-14⟩. ⟨hal-02946322⟩
Metrics
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