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Journal articles
Combed Single DNA Molecules Imaged by Secondary Ion Mass Spectrometry
Armelle Cabin-Flaman
1
Anne-Françoise Monnier
Yannick Coffinier
2
Jean-Nicolas Audinot
3
David Gibouin
4
Tom Wirtz
5
Rabah Boukherroub
2
Henri-Noël Migeon
Aaron Bensimon
Laurent Jannière
Camille Ripoll
6
Vic Norris
7
Armelle Cabin-Flaman 1
Author IdHAL : armelle-cabin ORCID : https://orcid.org/0000-0002-9738-6776
Anne-Françoise Monnier
Author
Yannick Coffinier 2
Author IdHAL : yannick-coffinier ORCID : https://orcid.org/0000-0001-7433-2102
Jean-Nicolas Audinot 3
Author
David Gibouin 4
Author IdHAL : david-gibouin
Tom Wirtz 5
Author
Rabah Boukherroub 2
Author IdHAL : rabah-boukherroub ORCID : https://orcid.org/0000-0002-9795-9888
Henri-Noël Migeon
Author
Aaron Bensimon
Author
Laurent Jannière
Author IdHAL : laurent-janniere ORCID : https://orcid.org/0000-0003-2353-3160
Camille Ripoll 6
Author
Vic Norris 7
Author
1
UNIROUEN - Université de Rouen Normandie (1, rue Thomas Becket 76821 Mont-Saint-Aignan Cedex - France)
- NU - Normandie Université (Esplanade de la Paix - CS 14032 - 14032 Caen Cedex 5 - France)
2
IRI - Institut de Recherche Interdisciplinaire [Villeneuve d'Ascq] (Parc de la Haute Borne 50 avenue de Halley BP 70478 59658 Villeneuve d'Ascq Cedex - France)
- Université de Lille, Sciences et Technologies (Cité Scientifique - 59655 Villeneuve d'Ascq Cedex - France)
- Université de Lille, Droit et Santé (42 rue Paul Duez 59000 Lille - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : USR3078 (France)
3
Dept Sci & Anal Mat (Luxembourg)
4
GPM - Groupe de physique des matériaux (Avenue de l'Université, BP 08, 76801 Saint-Etienne-du-Rouvray Cedex - France)
- UNIROUEN - Université de Rouen Normandie (1, rue Thomas Becket 76821 Mont-Saint-Aignan Cedex - France)
- NU - Normandie Université (Esplanade de la Paix - CS 14032 - 14032 Caen Cedex 5 - France)
- INSA Rouen Normandie - Institut national des sciences appliquées Rouen Normandie (Avenue de l’Université 76801 Saint-Étienne-du-Rouvray Cedex - France)
- NU - Normandie Université (Esplanade de la Paix - CS 14032 - 14032 Caen Cedex 5 - France)
- INSA - Institut National des Sciences Appliquées (France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR6634 (France)
6
GTCV - Glycobiologie et transports chez les végétaux (bat. Biologie (extension) Place Emile Blondel 76821 MONT ST AIGNAN CEDEX - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR6037 (France)
- UNIROUEN - Université de Rouen Normandie (1, rue Thomas Becket 76821 Mont-Saint-Aignan Cedex - France)
- NU - Normandie Université (Esplanade de la Paix - CS 14032 - 14032 Caen Cedex 5 - France)
7
ISSB - Institut de biologie systémique et synthétique (5 rue Henri Desbruères F-91030 ÉVRY CEDEX - France)
- UEVE - Université d'Évry-Val-d'Essonne : EA4527 (Boulevard François Mitterrand 91025 Evry Cedex - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UPS3509 (France)
Abstract : Studies of replication, recombination, and rearrangements at the level of individual molecules of DNA are often limited by problems of resolution or of perturbations caused by the modifications that are needed for imaging. The Combing-Imaging by Secondary Ion Mass Spectrometry (SIMS) (CIS) method helps solve these problems by combining DNA combing, cesium flooding, and quantitative imaging via the NanoSIMS 50. We show here that CIS can reveal, on the 50 nm scale, individual DNA fibers labeled with different, nonradioactive isotopes and, moreover, that it can quantify these isotopes so as to detect and measure the length of one or more short nucleic acid fragments associated with a longer fiber.
Keywords :
chemistry
analytical
Document type :
Journal articles
Complete list of metadatas
https://hal-normandie-univ.archives-ouvertes.fr/hal-02115900
Contributor : David Gibouin <>
Submitted on : Tuesday, April 30, 2019 - 3:30:04 PM
Last modification on : Monday, December 7, 2020 - 2:54:24 PM
Contributor : David Gibouin <>
Submitted on : Tuesday, April 30, 2019 - 3:30:04 PM
Last modification on : Monday, December 7, 2020 - 2:54:24 PM
Identifiers
- HAL Id : hal-02115900, version 1
- DOI : 10.1021/ac201685t
- PRODINRA : 177493
- WOS : 000294790000006
Collections
COMUE-NORMANDIE | CNRS | ISSB | GPM | INSA-ROUEN | UNIROUEN | INSA-GROUPE | UNIV-EVRY
Citation
Armelle Cabin-Flaman, Anne-Françoise Monnier, Yannick Coffinier, Jean-Nicolas Audinot, David Gibouin, et al.. Combed Single DNA Molecules Imaged by Secondary Ion Mass Spectrometry. Analytical Chemistry, American Chemical Society, 2011, 83 (18), pp.6940-6947. ⟨10.1021/ac201685t⟩. ⟨hal-02115900⟩
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