Interopérabilité sémantique entre vocabulaires contrôlés. évaluation de la qualité des alignements sur des données de standards du diagnostic in vitro

Résumé : L’informatisation des données de santé doit relever le défi de l’interopérabilité syntaxique, mais surtout sémantique, entre les systèmes d’information ainsi que et les systèmes d’organisation des connaissances (SOC) sur lesquels ils reposent. L’intégration des connaissances entre SOC est une problématique largement étudiée notamment dans des domaines de la biologie ou la santé. Le diagnostic in vitro (DIV) à l’interface de la médecine et de la biologie, doit répondre aux mêmes problématiques d’interopérabilité avec des outils adaptés à la nature multi et transdisciplinaire de ses données. Dans cet article, nous proposons une revue de littérature des algorithmes existants pour le liage des données. À partir de cette revue nous proposons une évaluation d’alignement de concepts issus du DIV présents dans les SOC de référence disponibles en ligne. Les méthodes que nous proposons reposent sur trois mesures de similarité syntaxique et un algorithme heuristique. Les résultats que nous obtenons dans cette étude montrent que les métriques de similarité syntaxique ne se révèlent pas suffisamment probantes pour se voir appliquer de manière systématique au domaine des tests de laboratoire. En revanche, la qualité des alignements obtenus via l’algorithme heuristique, filtré a posteriori en fonction d’une dimension sémantique, permet de conforter les critères de performance que nous avions établis. Cet algorithme est notre piste privilégiée pour obtenir des alignements de qualité dans le domaine du DIV. Une seconde version de cet algorithme, en cours de développement, intègre l’ensemble des métriques syntaxiques et sémantiques étudiées dans l’article.
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Contributeur : Lina F Soualmia <>
Soumis le : lundi 15 avril 2019 - 19:19:13
Dernière modification le : lundi 29 avril 2019 - 14:24:38

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Citation

Mary Mélissa, Lina F. Soualmia, Gansel Xavier. Interopérabilité sémantique entre vocabulaires contrôlés. évaluation de la qualité des alignements sur des données de standards du diagnostic in vitro. Ingéniérie des Systèmes d'Information, Lavoisier, 2016, 21 (5-6), pp.55-83. ⟨10.3166/isi.21.5-6.55-83⟩. ⟨hal-02100413⟩

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